Отсутствие заявления не препятствует применению УСН.

Налогоплательщики иногда забывают подать в налоговую инспекцию заявление о переходе на упрощенную систему налогообложения. Однако суды считают, что организации и индивидуальные предприниматели в таких ситуациях все равно вправе работать на «упрощенке».
Так, ФАС Северо-Кавказского округа в постановлении от 01.09.2009 № А32-5160/2008-4/129-2009-29/15 указал, что порядок применения упрощенной системы является уведомительным, а не разрешительным. Поэтому суд решил, что гражданин, зарегистрировавшийся в качестве индивидуального предпринимателя, вправе применять УСН даже если он не представил в налоговую инспекцию заявление о переходе. Ведь налоговикам было известно о применении предпринимателем специального налогового режима, так как он регулярно сдавал отчетность в налоговую инспекцию, где ее принимали без каких-либо возражений. Учитывая эти обстоятельства, предприниматель имел полное право применять УСН.
С данными выводами согласился и Высший Арбитражный Суд РФ (определение от 16.12.2009 № ВАС-17030/09), отказав в передаче дела в Президиум ВАС РФ.
Раньше в подобных ситуациях суды приходили к аналогичным выводам (постановления ФАС Московского округа от 29.12.2008 № КА-А41/12325-08, ФАС Северо-Западного округа от 23.12.2008 № А56-2756/2008, а также определение ВАС РФ от 21.04.2009 № ВАС-4598/09).
Источник: Журнал «Упрощенка» http://26-2.ru